Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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NanogQ80Z64 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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