Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms