Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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