Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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