Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms