Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms