Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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