Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9aQ68FE2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms