Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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