Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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