Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sall3Q62255 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall3Q62255 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms