Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifi47Q61635 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms