Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms