Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms