Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms