Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms