Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms