Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms