Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl5Q5DTT4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms