Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk4Q3V129 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ulk4Q3V129 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms