Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms