Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm28047Q3US59 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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