Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms