Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp30Q3UN04 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms