Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc4Q3UJB9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms