Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms