Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Q3U6N9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Q3U6N9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Q3U6N9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms