Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms