Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21440Q3TTD8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm21440Q3TTD8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms