Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms