Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms