Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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