Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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