Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms