Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

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Length 1,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Znf541Q0GGX2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf541Q0GGX2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf541Q0GGX2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf541Q0GGX2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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