Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc4Q08624 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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