Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms