Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec23aQ01405 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms