Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms