Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms