Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Col8a1Q00780 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms