Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Stx2Q00262 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Stx2Q00262 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Stx2Q00262 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms