Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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