Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms