Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Otx1P80205 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms