Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta2P62737 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta2P62737 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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