Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnnP61807 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnnP61807 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnnP61807 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms