Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms