Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2nP61089 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms