Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TspoP50637 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TspoP50637 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TspoP50637 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TspoP50637 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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